Dix thèmes structurent la réflexion sur le programme à évaluer:

1. Finalité et pertinence du programme
2. Population étudiante
3. Structure et contenu de la formation
4. Pédagogie
5. Corps enseignant et gestion du programme
6. Soutien à la réussite étudiante
7. Formation à la recherche aux cycles supérieurs
8. Préparation à la transition après le programme
9. Insertion du programme dans son environnement institutionnel
10. Bilan de l’analyse du cheminement étudiant

Ces thèmes sont présentés de manière détaillée dans ce tableau extrait du Guide d'application du Protocole d'évaluation périodique.

Dans certains cas, une démarche d'évaluation allégée peut être proposée par le Bureau de la promotion de la qualité.